肾透明细胞癌病理分级相关基因的WGCNA筛选

摘要：

目的 挖掘肾透明细胞癌(ccRCC)病理分级相关基因.方法 从美国国立生物技术信息中心(NCBI)的基因综合表达(GEO)数据库下载101例ccRCC及101例癌旁组织芯片数据(GSE40435)及临床数据作为训练集,265例芯片数据(GSE73731)和临床数据及GEPIA数据库中623例ccRCC相关数据作为测试集,利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和蛋白互作网络(PPI)分析与ccRCC病理分级密切相关的核心基因.结果 通过WGCNA和PPI网络在训练集GSE40435筛选出的红色模块与ccRCC病理分级的相关性最高,为显著性模块(R2=0.56),并挖掘出4个与ccRCC病理分级相关的核心基因(TOP2A、PTTG1、PRC1、UHRF1).在测试集GSE73731中,4个核心基因与ccRCC的病理分级和分期呈正相关(P<0.05),在测试集GEPIA数据库中,4个核心基因在ccRCC中高表达(P<0.05).生存分析发现,4个核心基因在ccRCC中高表达组的预后更差(P<0.05).结论 本研究通过WGCNA及PPI网络挖掘出的4个核心基因与ccRCC病理分级及预后相关,这可能为ccRCC的个体化治疗提供潜在的治疗靶点.

关键词：肾透明细胞癌;加权基因共表达网络分析;核心基因;预后

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在线出版日期：2021-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：9-15