基于生物信息学探讨肾透明细胞癌女性与男性的DNA甲基化谱的异同

摘要：

目的 分析女性与男性肾透明细胞癌的DNA甲基化谱之间的异同,为临床个性化诊断与治疗肾透明细胞癌提供新的理论依据.方法 从肿瘤基因组图谱(TCGA)与基因芯片公共数据库(GEO)中下载两种性别的肾透明细胞癌的DNA甲基化芯片数据,使用R语言minfi包对芯片数据进行预处理、对癌与癌旁组织进行差异分析,对两套不同来源的数据进行差异甲基化位点整合分析;使用单因素Cox回归分析计算预后甲基化位点;从生物通路角度,探讨差异甲基化位点与预后甲基化位点所涉及的潜在生物学功能.结果 女性与男性肾透明细胞癌的差异DNA甲基化位点仅有约68％是相同的,而预后DNA甲基化位点仅有约20％是相同的,两者的差异甲基化位点所涉及的生物通路相似,含多个经典的肿瘤信号通路,而预后甲基化位点所涉及的生物通路在一定程度是不同的.结论 女性与男性肾透明细胞癌的DNA甲基化谱具有性别特异性.

关键词：肾透明细胞癌、女性、男性、DNA甲基化

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在线出版日期：2020-11-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：148-152