甘薯4-香豆酸辅酶A连接酶基因的生物信息学鉴定和表达分析

摘要：

4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)在苯丙烷类代谢途径中具有重要调控作用.该研究利用转录组数据在甘薯品种QS48中鉴定了11个4CL基因,并将这些基因命名为Ib4CL1～Ib4CL11.序列比对和功能域分析发现,11个Ib4CL蛋白均具有典型的4CL结构特征,包含保守的Box Ⅰ和BoxⅡ的结构域.进化和保守基序分析显示,Ib4CL1和Ib4CL2属于Ⅰ类4CL,Ib4CL3属于Ⅱ类4CL,而Ib4CL4～Ib4CL11属于4CL类似蛋白.转录组数据和荧光定量PCR分析显示,Ib4CL3和Ib4CL10在甘薯QS48的叶中转录表达水平显著高于茎和块根,与绿原酸的积累呈正相关关系;Ib4CL4和Ib4CL8在嫩叶中表达较高,与花青素的积累密切相关.研究结果为进一步揭示甘薯4CL基因在苯丙烷类代谢途径中的功能奠定了基础.

关键词：甘薯、4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)、绿原酸、花青素、表达分析

所属期刊栏目：40

分类号：Q786;Q789(基因工程（遗传工程）)

资助基金：海南省科研院所技术开发专项KYYS2018-03

在线出版日期：2020-07-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：581-587