基于SSR分子标记构建南方型美洲黑杨初级核心种质

摘要：

以所收集的363份美洲黑杨无性系为实验材料,利用20对SSR引物扩增数据,设置10％、15％、20％、25％、30％、35％、40％共7个取样梯度构建南方型美洲黑杨初级核心种质,并采用平均观察等位基因数(Na)等遗传参数的t检验对核心种质有效性进行确认,以初级核心种质、保留种质以及原始种质三者之间平均观察等位基因数(Na)等遗传参数的保留比例作为评价指标,结合主坐标轴分析法对初级核心种质做进一步代表性确认.结果显示:(1)20对SSR引物共检测到278个多态位点,遗传多样性参数I、H分别为1.667和0.688 2,表明南方型美洲黑杨种质资源具有丰富的遗传变异.(2)比较平均Na、I、H变化确定15％为最佳取样比例,得到54份核心种质和309份保留种质,构建的初级核心种质与原始种质的平均Na、I、H经t检验不显着,除平均Na外其他平均遗传多样性参数,如Ne、Ho、I、H的保留率分别为111％、105％、104％和104％.(3)PCoA分析显示,所构建的初级核心种质不仅与原始种质分布相似,而且分散均匀覆盖较全面,可以代表原始种质在图中的几何分布.研究认为,所构建的45份初级核心种质保存了原始种质大部分的等位基因和基因型,剔除了原始种质的遗传冗余度和遗传重复度,具有更高的遗传多样性参数保留率,能全面代表原始种质的遗传多样性.

关键词：南方型美洲黑杨、初级核心种质、SSR

所属期刊栏目：39

分类号：Q346+.5;Q789(遗传学分支学科)

资助基金：“十三五”国家重点研发计划2016YFD0600402;湖北省技术创新重大专项2016ABA111

在线出版日期：2019-04-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：250-257