菘蓝MYB34基因的克隆及其表达分析

摘要：

该研究以菘蓝新鲜嫩叶为材料,采用RT-PCR方法,克隆了菘蓝IiMY B34基因(GenBank登录号为MF373610),并对其进行生物信息学和表达模式分析.结果表明:(1)IiMYB34基因组DNA全长为1854 bp,包含3个外显子和2个内含子;ORF全长为951 bp,编码316个氨基酸;IiM YB34蛋白二级结构中无规则卷曲和α-螺旋所占比例最多,延伸链较少,与其三级结构的预测结果相一致;IiMYB34基因序列还存在2个保守的MYB DNA-binding结构域,属于典型的R2R3-MYB蛋白;IiMYB34氨基酸序列与欧洲油菜、甘蓝等植物的亲缘关系较近.(2)qRT-PCR分析显示,IiMY B34基因呈组织特异性表达,并在叶中表达量最高;茉莉酸甲酯、水杨酸及葡萄糖均显著诱导该基因的表达,而低温(4℃)和机械伤害处理对其表达具有一定的抑制效应.该研究结果为进一步揭示IiMY B34基因的功能奠定了基础.

关键词：菘蓝、IiMYB34、基因克隆、生物信息学、表达模式

所属期刊栏目：37

分类号：Q785;Q786(基因工程（遗传工程）)

资助基金：陕西省自然科学基金2016JQ3007;中央高校基本科研业务费专项资金GK201703075

在线出版日期：2018-01-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2139-2145