东乡野生稻及其渐渗系应答低磷胁迫的基因差异表达分析

摘要：

以东乡野生稻耐低磷渐渗系IL171及其双亲(栽培稻‘协青早B’和东乡野生稻)为试材,采用cDNA-AFLP技术分析其幼苗期应答低磷胁迫的差异表达谱特征,并采用实时荧光定量PCR分析验证差异表达基因的表达特性,为探究东乡野生稻耐低磷胁迫的分子机制、发掘耐低磷相关的基因奠定基础.结果显示:(1)基于17对扩增效果较好的cDNA-AFLP引物分析发现,不同胁迫时间的参试材料与其对照组(正常磷水平)相比,具有很多(20～159个)上调或下调表达的差异片段.(2)与‘协青早B’相比,IL171中特异性上调的差异带有36条,下调表达61条,而东乡野生稻中分别有79条和136条;IL171与东乡野生稻共有的上调差异带为13条,下调差异带有15条.(3)回收纯化其中60条特异性差异表达条带,最终克隆测序获得50个差异表达基因片段TDFs;通过Blast比对和功能分析,可将TDFs分为8类,包括能量与代谢、基因表达调控、信号转导和转录因子等.(4)实时荧光定量PCR验证其中6个TDFs发现,各差异片段的荧光定量PCR表达模式与cDNA-AFLP结果一致,表明该实验的cDNA-AFLP差异表达结果可靠,东乡野生稻的部分耐低磷相关基因已成功导入到渐渗系中,是发掘利用东乡野生稻耐低磷相关基因、探究其耐低磷分子机制的重要资源.

关键词：东乡野生稻、低磷胁迫、cDNA-AFLP、实时荧光定量PCR

所属期刊栏目：35

分类号：Q789(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金31260255;江西省教育厅科技计划GJJ12184;江西省科技支撑计划20122BBF60064;江西省青年科学家培养计划20112BCB23007

在线出版日期：2016-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：2405-2413