小麦TaLSD1锌指蛋白基因的电子克隆及序列分析

摘要：

采用电子克隆与RT-PCR相结合的技术,在条锈菌(Puccinia striiformis f.sp.tritici)侵染的小麦中克隆了一个LSD1型锌指蛋白基因,命名为TaLSD1(GenBank登录号为EF553327).序列分析表明,该基因全长1 024bp,编码生成1个包含3个保守LSD1型锌指结构(CxxCxRxxLMYxxGASxVxCxxC)且长度为146个氨基酸的多肽.进化树分析表明,TaLSD1与水稻(Oryza sativa)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和芜菁(Brassica rapa)中部分含有3个保守LSD1型锌指结构的同源基因亲缘关系较近,而与其它包含不同数目的LSD1型锌指结构基因亲缘关系较远.推测TaLSD1在进化中丢失了部分序列,进而执行新的功能.半定量RT-PCR结果显示,该基因在亲和以及非亲和组合中的表达模式很相似,均表现在前期基因表达被抑制而后期恢复正常.初步推测TaLSD1在转录水平上的表达受光诱导,同时,作为一个细胞程序性死亡的负调控因子在小麦与条锈菌互作过程中起作用.

关键词：条锈菌、电子克隆、进化树分析、半定量RT-PCR、LSD1型锌指结构

所属期刊栏目：27

分类号：Q789(基因工程（遗传工程）)

资助基金：教育部科技计划2004-295;教育部长江学者和创新团队发展计划IRT0558;国家自然科学基金30671350;高等学校学科创新引智计划B07049

在线出版日期：2008-01-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2147-2152