结直肠癌中LncRNA介导的内源性竞争性RNA调控网络

摘要：

目的 构建结直肠癌RNA调控网络,探讨结直肠癌中分子调控机制.方法 从TCGA数据库中提取结直肠癌转录水平表达数据,筛选差异表达RNAs,结合miRDB,miRcode,miRTarBase和TargetScan数据库靶基因预测结果,整合LncRNA-miRNA、miRNA-mRNA关系对,基于ceRNA假说及LncRNA细胞内定位,筛选出胞质表达并介导该网络调控的LncRNA,重建结直肠癌中lncRNA-miRNA-mRNA作用网络.结果 在结直肠癌差异表达基因分析中初步筛选出119个LncRNA、32个miRNA以及59个mRNA;识别777对LncRNA-miRNA与77对miRNA-mRNA,基于ceRNA假说以及LncRNA在细胞内定位,最后筛选出15个上调LncRNA、3个下调miRNA(hsa-mir-145,hsa-mir-193b,hsa-mir-150)以及5个上调mRNA重建ceRNA网络.结论 成功构建结直肠癌中LncRNA介导调控的ceRNA网络,识别出预后相关的潜在靶点,为结直肠癌治疗研究提供了新的参考依据.

关键词：结直肠癌、TCGA、肿瘤标志物、内源性竞争性RNA

所属期刊栏目：32

分类号：R735.3;R730.43(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;湖北省自然科学基金;武汉大学珞珈青年学者科研基金351人才计划;武汉大学学位与研究生教育教学改革研究项目2018;2018年武汉大学医学部教学改革研究项目

在线出版日期：2020-04-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：166-170