IgG Fc段结合蛋白(FCGBP)作为低级别胶质瘤预后标志物的可能性及与免疫浸润的相关性分析
目的 探讨IgG Fc段结合蛋白(FCGBP)作为低级别胶质瘤(LGG)预后标志物的可能性及与免疫浸润的相关性.方法 利用癌症基因组图谱(TCGA)、基因型组织表达(GTEX)和中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据库分析FCGBP在泛癌中的表达情况;选择GSE15824和GSE68848数据集进行验证;利用基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库和R语言分析FCGBP与生存预后的关系;基因注释工具Metascape和基因子集富集分析(GSEA)进行功能注释和富集分析;最后利用肿瘤免疫浸润评分(TIMER)数据库分析FCGBP基因在LGG免疫微环境中的表达及与免疫细胞的相关性.结果 FCGBP在LGG组织中高表达,FCGBP高表达提示LGG患者预后不良,受试者工作特征(ROC)曲线分析和多因素风险比例回归模型(COX)分析表明FCGBP是LGG预后的独立危险因素;基因本体论(GO)分析表明,FCGBP参与细胞代谢、定位、正反向调节生物过程,同时参与生物黏附,对病毒及微生物刺激进行应答,参与炎症反应;GSEA通路富集分析表明,FCGBP与Janus激酶/信号转导子与转录激活子(JAK/STAT)通路、Toll样受体(TLR)通路、趋化因子通路和P53通路均具有显著相关性;FCGBP的表达与LGG免疫微环境中大多数免疫细胞的表达正相关.结论 LGG中FCGBP高表达是患者生存预后的危险因素,且与免疫细胞表达正相关.
IgG Fc段结合蛋白(FCGBP)、低级别胶质瘤、总生存期、免疫浸润
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R739.41;R730.7;R392.12;Q811.4(肿瘤学)
唐都医院创新基金2018LCYJ013
2023-11-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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