加权基因共表达网络分析筛选结肠腺癌预后相关的免疫标志物

摘要：

目的 寻找结肠腺癌(COAD)免疫相关预后标志物,以期能够准确预测COAD患者预后.方法 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析COAD患者免疫相关差异基因,通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)与COX回归分析得到风险模型,根据风险值的中位值将患者分为高、低风险组,比较两者预后,在基因表达数据集(GEO)数据库中验证模型.结果 通过分析共得到1015个免疫相关差异基因.COX回归分析得到由维甲酸受体相关孤核受体C(RORC)、富含亮氨酸重复序列Fli-I相互作用蛋白2(LRRFIP2)、半乳糖凝集素4(LGALS4)构成的风险模型,高风险组较低风险组预后较差并在GEO中得到验证,通过单因素与多因素COX分析发现模型可作为COAD患者独立预后风险模型.结论 通过免疫相关预后差异基因建立模型,可以预测COAD患者预后.

关键词：结肠腺癌、免疫相关基因、维甲酸受体相关孤核受体C(RORC)、富含亮氨酸重复序列Fli-I相互作用蛋白2(LRRFIP2)、半乳糖凝集素4(LGALS4/galectin-4)、癌症基因组图谱(TCGA)、预后

所属期刊栏目：39

分类号：R656.9;R857.3;R735.3+5;R730.7(外科学各论)

资助基金：国家自然科学基金81660400

在线出版日期：2023-08-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：509-515