生物信息学分析神经元钙蛋白1(CALN1)在胶质瘤中表达的临床意义及其与免疫细胞浸润的相关性
目的 采用生物信息学方法分析神经元钙蛋白1(CALN1)在胶质瘤中表达的临床意义及其在肿瘤免疫细胞浸润中的作用.方法 利用仙桃学术在线分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库中CALN1基因在胶质瘤中的表达情况,采用Kaplan-Meier生存分析法评价其预后价值,利用受试者工作特征(ROC)曲线评价其临床诊断效能,采用基因集富集分析(GSEA)探究CALN1在胶质瘤中的潜在作用机制,探讨CALN1 mRNA与胶质瘤免疫细胞浸润的关系.结果 胶质瘤中CALN1表达显著降低,且其表达水平与肿瘤分级负相关.与对照组比,CALN1在异柠檬酸脱氢酶突变型和染色体1p/19q共缺失胶质瘤中表达水平显著升高.CALN1低表达的胶质瘤患者预后较差,整体存活率、疾病相关存活率和无进展间隔期显著降低.ROC曲线分析显示CALN1表达水平具有较好的临床诊断价值.GSEA基因富集结果提示CALN1表达水平与有丝分裂和中性粒细胞脱颗粒负相关.免疫浸润分析显示CALN1低表达组中2型辅助T(Th2)细胞、巨噬细胞和中性粒细胞显著升高.结论 胶质瘤中CALN1表达水平与预后正相关,其表达异常降低可导致具有促肿瘤作用的免疫细胞浸润.CALN1可作为胶质瘤预后判断的潜在标志物和治疗靶点.
癌症基因组图谱(TCGA)、胶质瘤、神经元钙蛋白1(CALN1)、免疫细胞浸润
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S853.53;Q297;R392(动物医学（兽医学）)
国家自然科学基金;肿瘤生物学国家重点实验室自主课题;陕西省重点研发计划
2023-05-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
205-212
