IL-17调控溃疡性结肠炎分子机制的生物信息学分析
目的 利用生物信息学方法分析溃疡性结肠炎(UC)的枢纽基因和关键通路.方法 通过基因表达数据库(GEO)下载UC表达谱芯片GSE134025.利用R语言的Limma包筛选UC组与正常组肠黏膜细胞差异表达基因,对这些基因进行GO和KEGG分析;利用STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI)并将结果导入Cytoscape筛选出核心基因;利用KEGG mapper绘制核心基因所在的信号通路图.结果 筛选出190个差异表达基因,其中147个上调,43个下调.GO分析结果表明,差异表达基因主要涉及炎症反应、细胞增殖的正调控等生物学过程,主要富集于细胞膜、质膜等细胞成分,具有肝素结合、生长因子等分子功能.KEGG分析显示差异基因主要富集于趋化因子信号通路,细胞因子受体相互作用等相关信号通路.从PPI网络中筛选出10个枢纽基因:白细胞介素6(IL-6)、CXC趋化因子配体8(CXCL8)、CXCL10、CXCL1、CXCL9、膜联素A1(ANXA1)、IL-1β、CC趋化因子配体20(CCL20)、CXCL2、CXCL11,其中多个基因位于IL-17调控的信号通路下游.结论 发现了 10个与UC发病风险相关的枢纽基因,IL-17可能通过这些核心基因调控UC的发生发展.
溃疡性结肠炎、基因表达数据库、蛋白互作网络、核心基因
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R574.62;R364.5;R392.1(消化系及腹部疾病)
国家自然科学基金;山西省自然科学基金
2023-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共5页
21-25
