类风湿性关节炎患者巨噬细胞关键基因及信号通路的生物信息学分析

摘要：

目的 基于生物信息学方法筛选类风湿性关节炎(RA)患者巨噬细胞关键基因及信号通路.方法 下载基因表达数据集(GEO)数据库中RA患者滑膜巨噬细胞基因芯片,通过GE02R功能获得差异表达基因,利用基因蛋白质相互作用关系检索工具(STRING)数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络获得关键基因,对关键基因进行基因本体论(GO)及京都基因和基因组学百科全书(KEGG)富集分析.结果 通过整合3个基因芯片数据集,获得差异表达基因87个,进一步获得关键基因10个,富集分析发现关键基因与白细胞迁移、巨噬细胞分化、血小板脱颗粒、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)活性的正调控等生物学过程及磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号密切相关.结论 RA患者巨噬细胞的关键基因与炎症反应机制相关,可能参与RA慢性炎症的发病机制.

关键词：巨噬细胞、类风湿性关节炎(RA)、生物信息学、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)

所属期刊栏目：38

分类号：Q811.4;R593.22;R392.12;R364.5(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金;国家重点研发计划;全国中医药创新骨干人才培训项目;安徽省省级质量工程教学研究项目;安徽省名中医刘健工作室建设项目;安徽省115创新团队皖人才办号;安徽中医药大学研究生创新计划

在线出版日期：2023-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1063-1068