芪白平肺胶囊调控慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关免疫细胞群分子机制的生物信息学分析
目的 通过分析慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者肺组织单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据,并联合芪白平肺胶囊网络药理学,探讨芪白平肺胶囊调控COPD相关免疫细胞群及其可能的机制.方法 下载基因表达数据集(GEO)中COPD患者肺组织scRNA-seq数据用于挖掘COPD免疫细胞群及其差异表达RNA;并基于中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)获取芪白平肺胶囊的主要活性成分及其靶基因.通过COPD免疫细胞群的差异表达RNA与芪白平肺胶囊的靶基因映射,构建芪白平肺胶囊的"活性成分-免疫细胞群-靶基因"网络,并经基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、蛋白质相互作用(PPI)分析靶基因的分子作用机制.结果 芪白平肺胶囊中槲皮素(quercetin)、山奈酚(kaempferol)、刺芒柄花素(formononetin)等主要的12个活性成分靶向COPD巨噬细胞、肺泡巨噬细胞、T细胞等多个免疫细胞群及过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、应激活化蛋白激酶(JUN)、血红素加氧酶1(HMOX1)、低氧诱导因子1α(HIF1A)等基因,且这些基因主要富集于白细胞介素17(IL-17)信号通路、核因子κB(NF-κB)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路等.结论 芪白平肺胶囊可能靶向多种免疫细胞,干预炎症免疫相关通路,调控COPD的炎症免疫反应.
芪白平肺胶囊、慢性阻塞性肺疾病(COPD)、单细胞转录组测序、免疫细胞、中医
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Q811.4;R563;R364.5;R392-33;R392(生物工程学(生物技术))
国家自然科学基金;国家自然科学基金;中国博士后基金;安徽省科技重大专项;安徽省自然科学基金;安徽省自然科学基金;新安医学开放课题;安徽省高校协同创新项目;安徽省高校协同创新项目
2023-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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