系统性硬化症线粒体功能相关的差异表达基因的生物信息学分析

摘要：

目的 通过分析线粒体功能相关基因在系统性硬化症(SSc)患者皮肤活检组织中的表达情况来研究线粒体和SSc之间的关系.方法 使用基因表达汇编(GEO)数据库中SSc皮肤活检组织基因芯片表达谱数据,采用t检验和倍数变化(FC)的差异基因分析方法筛选出线粒体功能相关的差异表达基因(DEG),并对其进行功能注释、功能富集和蛋白质相互作用网络分析.结果 在SSc组织中共识别出422个显著差异的DEG,其中23个DEG是线粒体功能相关基因.对这23个基因进行功能注释和富集分析,发现异常表达的线粒体功能相关基因主要影响线粒体能量供应、细胞代谢等生物学过程.结论 SSc的发生发展伴随着线粒体功能相关基因的异常表达,提示线粒体功能异常与SSc发病相关.

关键词：系统性硬化症(SSc)、线粒体、差异表达基因(DEG)

所属期刊栏目：35

分类号：Q731;R744.5+1;Q786;Q344+.13(生物膜的结构和功能)

资助基金：陕西省卫生和计划生育委员会资助项目2018ZDXM-SF-061;赣南医学院校级重点项目ZD201820;赣南医学院校级博士启动课题QD201812

在线出版日期：2019-12-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：707-713