用DNAStar软件预测Rv1410c结核分枝杆菌蛋白抗原表位
目的 预测Rv1410c结核分枝杆菌(MTB)的抗原表位.方法 利用DNAStar软件包中Editseq软件将Rv1410c MTB氨基酸序列进行编辑保存,然后利用Protean软件进行氨基酸序列分析,预测Rv1410c MTB的二级结构、B细胞抗原表位及T细胞抗原表位,然后再用BLAST分析其与人类抗原表位的同源性.结果 Rv1410c具有丰富的二级结构,含有较多潜在的B细胞抗原肽表位,主要位于1 ~ 10、67 ~77、129 ~ 137、189 ~205、222~235、253 ~ 267、296 ~ 306、330 ~ 338、359 ~367、462~467、494~517氨基酸残基或其附近,这些区域基本上含有β转角结构,亲水性、表面可能性和柔韧性指数都较高;也含有较多潜在的T细胞表位,主要位于16 ~37、84 ~102、108 ~115、137~ 160、202 ~ 207、219 ~222、245 ~263、321 ~325、355 ~362、387 ~391、417 ~445、486 ~494氨基酸残基或其附近.结论 Rv1410c MTB既含有较多潜在的B细胞抗原表位,也含有较多潜在的T细胞抗原表位.
抗原表位、DNAStar软件、结核分枝杆菌、Rv1410c、二级结构
31
R857.3;Q518.1;R378.91+1(航空航天医学)
国家重大传染病防治科技重大专项基金2012ZX10003008002;军队医学科技“十二五”重点项目BWS11J050;北京市科技创新基地培育与发展工程专项Z141107004414021
2015-05-12(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
474-477