肺结核患者痰液细胞和血清中miR-618的水平变化及功能预测

摘要：

目的 检测肺结核患者痰液和血清中miR-618的水平变化及miR-618靶基因细胞因子IL-13的含量,并用生物信息学技术和软件对miR-618的功能进行预测分析.方法 收集健康对照和活动性肺结核患者的痰液和血清,用核酸杂交和实时定量PCR(qRT-PCR)检测痰液和血清中miR-618的水平.用ELISA检测IL-13的含量.TargetScan预测miR-618的靶基因,用DAVID数据库和Cytoscape的BINGO插件对miR-618的预测靶基因进行GO注释分析和生物通路分析.结果 杂交和qRT-PCR结果显示:miR-618在活动性肺结核患者痰液和血清中的水平均比健康对照组显著降低(P＜0.05).IL-13含量虽然在对照组和结核组中无统计学差异,但在结核组有增高的趋势.miR-618预测靶基因的GO注释结果富集在转录调控等生物学过程、DNA结合等分子功能等方面(P＜0.05)；在KEGG通路数据库中miR-618a预测靶基因主要富集于TGF-β信号通路中(P＜0.05).结论 miR-618在活动性肺结核感染患者痰液和血清中的含量都明显降低,miR-618的靶基因主要参与转录调控、RNA代谢等生物学过程.

关键词：肺结核、miR-618、IL-13、靶基因、生物信息学

所属期刊栏目：29

分类号：R392.11;R378;Q811.4

资助基金：国家自然科学基金81100006;山东省自然科学基金ZR2010HM073

在线出版日期：2013-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：846-849