湖南大围子猪SLA-DR基因克隆及其生物信息学分析

摘要：

目的:研究湖南大围子猪SLA-DR基因特性, 评价该猪种在异种器官移植中是否具有应用前景.方法:应用RT-PCR扩增大围子猪SLA-DRA和SLA-DRB基因, 插入pUCM-T载体, 双向测序, 用NCBI中的BLAST和ExPASY软件进行生物信息学分析.结果:大围子猪SLA-DRA和SLA-DRB基因扩增片段大小分别为1 177 bp和909 bp, 均包含完整的开放阅读框, 分别编码252和266个氨基酸残基.生物信息学分析结果表明, 大围子猪SLA-DRA和SLA-DRB与人类相应的DRA、 DRB相比, 氨基酸同源性分别为82%和73%.SLA DR α链与人CD4 分子结合部位介于第124 至136 位氨基酸, 大围子猪SLA-DRA在该结合区域与人类相应的DRA存在两个氨基酸差异, 即:第127位(lle→Val), 第136位(Ser→Thr);SLA DR β链与人CD4 分子结合部位位于第134至148位氨基酸, 大围子猪SLA-DRB在该结合区域与人类相应的DRB相比氨基酸序列完全相同.与国际GenBank 已登录的许多猪种相比, SLA-DRA基因同源性高达100%, 而SLA-DRB基因在各猪种之间具有很高的多态性.结论:克隆湖南大围子猪SLA-DRA和SLA-DRB基因, 该基因与人类相应的HLA-DRA和HLA-DRB基因高度同源, 提示该猪种有望作为异种移植的候选供体.

关键词：SLA-DR基因、湖南大围子猪、基因克隆、异种移植

所属期刊栏目：25

分类号：R392.4

资助基金：湖南省自然科学基金重点项目07JJ3066;湖南省卫生厅资助项目B2006-080

在线出版日期：2009-11-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：770-773