丝瓜LcWRKY21转录因子基因的克隆与表达分析
采用RT-PCR和Race技术从普通丝瓜果肉中分离到1条长达1 809 bp的cDNA,并对其进行序列分析.结果表明,该序列包含1个1 044 bp的开放读码框(open reading frame,ORF);预测编码347个氨基酸,理论分子量为38.61 kDa,等电点为9.46;编码蛋白质与甜瓜(Cucumis melo)和黄瓜(Cucumis sativus)同源蛋白的相似性达到84％以上,具有高度的保守性,基因命名为Lc WRKY21.Wolf Psort预测其亚细胞定位于细胞核(nucleus)内.Motif Scan分析显示,LcWRKY21蛋白质的氨基酸序列274～340位、279～339位和325—337位分别为WRKY保守结构域、DNA结合结构域及锌指结构域序列.同源性分析表明,丝瓜LcWRKY21的锌指结构为C2H2型,属于第Ⅱ类WRKY蛋白质家族.荧光定量PCR(Real-time quantitative polymerase chain reaction,qPCR)分析显示,Lc WRKY21具有组织表达特异性,在普通丝瓜品种“福丝2号”果实中表达量最高,其次为根和茎,在叶片和花中的表达量较低.Lc WRK Y21基因在6个丝瓜品种中的表达水平具有品种差异性,在易褐变普通丝瓜品种“福丝2号”中的表达量最高,其次为普通丝瓜“福丝3号”和“福丝4号”,在有棱丝瓜“福丝5号”、“福丝6号”和不易褐变的普通丝瓜品种“福丝1号”中的表达量较低.分析发现,LcWRKY21在“福丝2号”不同成熟时期中的表达量呈先上调后下调的趋势,在授粉后35 d的表达丰度达到最高.此外,Lc WRKY21在普通丝瓜品种“福丝2号”的表达水平呈先上调后下调的趋势,鲜切后3h时表达量达到最高,随后出现下调.初步推测,转录因子Lc WRKY21基因在丝瓜果肉褐变过程中起着一定的调控作用.
丝瓜、LcWRKY21、转录因子、基因克隆、表达分析
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S64;R73
福建省属公益类科研院所基本科研专项2017R1026-3;福建省农业科学院青年人才创新基金2015QC-6;福建省农业科学院创新团队PI项目2016PI-40;国家大宗蔬菜产业体系福州试验站批准号:CARS-25-G-20资助的课题 This work was supported by Fujian Provincial Public Research Institute of Fundamental ResearchGrant 2017R1026-3;Young Talent Innovation Fund of Fujian Academy of Agricultural SciencesGrant 2015QC-6;Project of Innovative Team in Fujian Academy of Agricultural SciencesGrant 2016PI-40;the Experimental Station of Fuzhou of China Commodity Vegetable Industry SystemGrant CARS-25-G-20
2017-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共11页
1268-1278
