霍山石斛托品酮还原酶基因的克隆及其表达分析

摘要：

为了探究托品酮还原酶(tropinone reductase,TR)基因在石斛中的功能,该研究采用RT-PCR结合RACE技术,以霍山石斛原球茎为材料,克隆得到霍山石斛TR-I基因的cDNA序列,其在GenBank中的登录号为KY912085. TR-I基因的cDNA长1 043 bp,包含一个完整的共807 bp的ORF(open reading frame)(79-885),共编码268个氨基酸.生物信息学分析表明,该蛋白质可能是一种疏水性稳定蛋白质,无信号肽,不合卷曲螺旋结构,具有14个功能位点、47个潜在磷酸化位点,其二级结构由螺旋、折叠和卷曲结构组成.系统进化树分析表明,霍山石斛TR-I与铁皮石斛、金钗石斛的亲缘关系较近,处于同一分支.qPCR结果显示,TR-I基因在霍山石斛不同生长期的相对表达量均表现为茎＞叶＞根,且茎和叶中TR-I的表达量均随着生长期的延长呈现低-高-低的变化趋势;在不同品种中,金钗石斛的TR-I基因相对表达量最高,铁皮石斛中最低;不同浓度茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)处理比较,100 μmol/L茉莉酸甲酯处理下TR-I基因表达量最高,推测该基因可能参与霍山石斛生物碱的合成途径.

关键词：霍山石斛、托品酮还原酶、基因克隆、qPCR

所属期刊栏目：39

分类号：R28;S68

资助基金：福建省农业科学院作物研究所青年开放基金项目2015QN-4;福建省省属公益类科研院所专项2015R1026-8;福建省农业科学院科技创新项目2015CX-1;福建省农业科学院科技创新团队建设2016PI-39资助的课题;the Youth Open Fund of Crop Research Institute by Fujian Academy of Agricultural SciencesGrant 2015QN-4;the Public Welfare Foundation of Fujian ProvinceGrant 2015R1026-8;the Project of Technology Innovation by Fujian Academy of Agricultural SciencesGrant 2015CX-1;the Development of Technology Innovation by Fujian Academy of Agricultural SciencesGrant 2016PI-39

在线出版日期：2017-10-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1196-1206