小麦条锈菌新菌系CYR34中CDK5基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

为探究细胞周期蛋白依赖性激酶(Cyclin-dependent kinase 5,CDK5)在小麦条锈菌(Puccinia stri-iformis f.sp.tritici)新菌系CYR34夏孢子萌发过程的毒性作用,以天水地区小麦条锈菌新菌系CYR34夏孢子标样为试材,通过RACE 克隆 CDK5基因并对其进行生物信息学分析,获得长度为706 bp,编码190个氨基酸的cDNA序列.蛋白质结构预测显示,其二级结构主要以α-螺旋为主,且具有典型的STKC激酶结构域.同源性分析显示,CDK5与小麦杆锈菌(Puccinia graminis f.sp.tritici)中的CDK5亲缘关系较近.蛋白质互作数据库预测分析发现,CDK5可以与磷酸核酮糖3-差异构酶、荚膜生物合成蛋白、鸟苷酸激酶、丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶、16S rRNA蛋白以及肌苷-5'-单磷酸脱氢酶6个蛋白互作关系;基因时序表达发现在孢子萌发0～6 h时,基因的表达量持续下调,6 h后表现为上调,萌发10 h后为对照的1.2倍,萌发14 h后基因的表达量达趋于平台期,为对照的1.36倍.综上所述,推测细胞周期蛋白依赖性激酶CDK5在小麦条锈菌(CYR34)夏孢子萌发过程中参与了适应环境的信号调控.

关键词：小麦条锈菌、CDK5、基因克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：33

分类号：TS207.4;R73;Q936

在线出版日期：2024-02-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：133-140