小麦籽粒镉元素含量全基因组关联分析及候选基因预测

摘要：

以国内外207份小麦种质为材料,利用660K SNP芯片对其进行基因型检测,并结合不同环境下表型数据和最佳线性无偏预测值(BLUP,Best linear unbiased prediction)对小麦籽粒镉元素含量进行全基因组关联分析.结果表明:与小麦籽粒镉元素含量显著关联的SNP 310个,这些SNP分布于除3D和4D外的19条染色体上,单个SNP解释变异率为10.95％～14.66％.不同环境下检测到的关联SNP结果存在差异,其中在原阳地区检测到186个SNP,开封地区检测到71个SNP.基于BLUP值分析获得53个SNP.基于SNP物理位置,将距离较近的SNP进行整合,共获得有效QTL位点52个.同时发现了 7个在多环境下表现稳定的SNP,并对其进行单标记效应分析.最后对基于获得的关联SNP进行了候选基因预测,共获得7个与小麦籽粒镉元素含量相关的候选基因,其中TraesCS1B01G321700和TraesCS1B01G320200可能与镉元素调控相关基因转录有关,而TraesCS7B01G459000和TraesCS7B01G456900可能与镉元素的吸收和转运等代谢过程有关.还筛选出了对镉具有良好避性的部分小麦优异种质,如'云麦51''郑麦379''白穗白''云麦53''双丰收'.

关键词：小麦、Cd含量、SNP芯片、全基因组关联分析

所属期刊栏目：33

分类号：S828.2;F713.36;P445

在线出版日期：2024-02-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：29-38