基于线粒体Cytb基因和D-loop区的鸭绿江流域细鳞鱼群体遗传多样性

摘要：

旨在研究鸭绿江流域(丹东段)细鳞鱼野生群体与养殖群体的遗传多样性,并探究其种质资源情况.基于细鳞鱼线粒体DNA Cytb 基因和D-loop区序列,对宽甸(KD)和丹东江域(DD)2 个野生细鳞鱼群体和1 个养殖群体的遗传结构与遗传多样性等进行比较研究.结果表明:Cytb 基因 1 141 bp,A+T 含量53.55%,G+C含量 46.45%,D-loop区序列 988 bp,A+T 含量 62.75%,G+C 含量 37.25%;基于 Cytb 和D-loop序列在 90 个样本中分别检测到 42 和 56 个多态性位点,定义了 21 和 26 种单倍型,其中KD、DD和YZ群体 Cytb 基因的单倍型数分别为 14、10 和 7,KD、DD和 YZ群体D-loop区单倍型数分别为 16、15 和 10;遗传多样性分析 Cytb 基因表现出高单倍型多样性(0.986)和低核苷酸多样性(0.004 66),而 D-loop 区表现出高单倍型多样性(0.981)和高水平的核苷酸多样性(0.019 82),基于 Cytb 基因和D-loop区序列KD和DD群体分别具有 4 个和 2 个相同单倍型,说明 2 个细鳞鱼野生群体间的分化程度较小,而养殖群体与野生群体间遗传分化为中度;分子方差分析(AMOVA)发现群体内部的遗传变异(Cytb:73.38%;D-loop:85.91%)占比明显高于群体间的遗传变异(Cytb:26.62%;D-loop:14.09%),表明鸭绿江流域(丹东段)细鳞鱼群体遗传变异主要来源于群体内,不同地理群体间的遗传变异不大;群体单倍型系统发育树表明,KD、DD和 YZ 群体间互有交叉,均未表现出明显的地理聚集,3 个群体间尚未出现明显的地理谱系结构,结果与遗传多样性研究一致.Tajima's D和 Fu and Li's中性检验显著偏离中性,推测细鳞鱼 KD和 DD群体可能经历过群体扩张事件,随后处于相对平衡稳定状态.

关键词：鸭绿江流域、细鳞鱼、Cytb基因、D-loop区、群体遗传多样性

所属期刊栏目：32

分类号：R383;Q969.366.6;S865.9

在线出版日期：2023-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：1675-1685