10.7606/j.issn.1004-1389.2023.08.004
甘蓝型油菜WOX基因家族的鉴定与表达分析
对甘蓝型油菜WOX 基因家族进行研究,利用生物信息学方法鉴定到 58 个家族成员,对其理化性质、系统发育树、基因结构、保守结构域、染色体位置、顺式作用元件和表达模式等进行分析,结果表明:氨基酸长度为 121~397,分子质量为 13 962.77~44 157.46 u,等电点为 5.23~9.63,亲水性均小于 0,不稳定系数为42.12~75.63,亚细胞定位在细胞核和叶绿体;系统进化树将WOX 基因分为 3 大类和 9 个亚支;相同亚支的成员 motif和基因结构相似或相同;除 BnWOX1、BnWOX3、BnWOX4、BnWOX15、BnWOX32、BnWOX42、BnWOX43、BnWOX51、BnWOX53 基因外,其余 49 个BnWOX 基因不均匀分布在 19 条染色体中的 18 条染色体上(ChrC06 除外),有 38 对串联重复基因;基因上游序列中包含转录因子结合位点、逆境响应、光响应、激素响应、分生组织调控等顺式作用元件等;各组织器官表达分析表明,BnWOX 基因在根、茎尖、种子、角果中表达量较高;对WOX 基因进行定量分析发现,在冷胁迫和干旱胁迫下基因表达量有显著变化,表明BnWOX基因可能在油菜响应冷/旱胁迫的调控机制中发挥着重要作用.
甘蓝型油菜、WOX基因家族、系统进化、非生物胁迫
32
Q78;Q943.2;S813.3
2023-08-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共14页
1173-1186