10.7606/j.issn.1004-1389.2023.04.014
含羞草叶片转录组测序及其黄酮合成途径解析
为了解析含羞草中黄酮类物质的生物合成途径,利用Illumina platform 2000TM测序平台对含羞草叶片进行转录组测序,共获得94 182个Unigene,平均长度为695 bp,N50值为1 159 bp.共有30 243个Uni-gene 注释于50个GO功能组中,其中"代谢过程""催化活性"以及"细胞"注释的Unigene数量较多.KEGG通路分析鉴定出49个Unigene注释在黄酮生物合成途径,分别编码查尔酮合成酶(CHS,12个Unigene)、查尔酮异构酶(CHI,4)、黄烷酮-3-羟化酶(F3H,3)、黄烷酮-3'-羟化酶(F3'H,9)、黄烷酮-3',5'-羟化酶(F3',5'H,1)、二氢黄酮醇4-还原酶(DFR,5)、黄酮醇合成酶(FLS,3)以及无色花色素还原酶(LAR,12)基因.从转录组数据库中鉴定出7 382个以单核苷酸和三核苷酸为主要类型的SSR标记.随机选出10对SSR引物进行扩增,其中有7对能够扩增出清晰的条带.
含羞草、转录组测序、代谢途径、黄酮生物合成
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S542;F404.1;S791.11
延安大学科研启动项目;延安市高层次人才专项;延安市高层次人才专项;延安大学大学生创新项目
2023-03-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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