牦牛SMAD1基因第1外显子SNPs检测及与生长性状的关联分析

摘要：

研究牦牛SMAD1基因第1外显子SNPs与生长性状的关系,寻找与牦牛生长性状相关的分子标记.采用DNA测序和单倍型分型技术,对青海牦牛SMAD1基因进行SNPs检测及其基因分型、连锁不平衡和单倍型分析,并对多态位点的基因型及组合单倍型与牦牛生长性状的关联性进行分析.结果发现,SMAD1在第1外显子上存在5个突变位点,其中,g.35084C＞T、g.35111C＞T和g.35333G＞A均存在2种基因型,g.35171G＞A和g.35312C＞T均存在3种基因型.连锁不平衡分析发现5个位点间不存在强的连锁不平衡效应,单倍型分析发现存在6种不同的单倍型,其中单倍型Hap3的发生频率最高.关联性分析表明,g.35084C＞T位点与胸围显著相关,g.35111C＞T位点与体斜长、胸围显著相关,g.35171G＞A和g.35312C＞T位点与体质量、体高、体斜长和胸围显著相关,g.35333G＞A位点与胸围、体高显著相关.通过基因型组合发现,4种组合单倍型均与牦牛生长性状有着显著或极显著相关,且H3H6可能是影响牦牛生长性状的最优组合单倍型.综上所述,牦牛SM4D1基因第1外显子多态性丰富,且与部分生长性状显著关联,可作为牦牛分子标记辅助选择的候选基因.

关键词：牦牛、SMAD1基因、单倍型、SNP、生长性状

所属期刊栏目：32

分类号：S812.8;S511;R749.3

资助基金：国家自然科学基金;青海省科技项目;青海省科技项目

在线出版日期：2023-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：179-186