西瓜PIP5K基因家族鉴定及其在雄性不育花蕾中的表达分析

摘要：

为了挖掘西瓜磷脂酰肌醇4-磷酸5-激酶(PIP5K)基因的功能,利用生物信息学方法对西瓜PIP5K家族成员进行鉴定和特征分析,并对其在多个组织的表达模式进行分析研究.结果显示:西瓜基因组中含有8个PIP5K家族成员,分布在6条染色体上;多数基因定位在细胞质或细胞膜上;共线性分析发现4个ClaPIP5K基因与5个AtPIP5K基因存在共线关系,并且ClaPIP5K基因间存在片段复制事件;进化树分析发现ClaPIP5K基因和AtPIP5K基因被分成4组,并且同一组内的基因具有相似的保守基序和基因结构;启动子分析发现ClaPIP5K基因中含有激素和胁迫响应相关顺式作用元件;表达分析显示ClaPIP5K基因在西瓜生长点、果柄、果肉、叶片、下胚轴、根以及花蕾等组织中表现出不同的表达水平.

关键词：西瓜;PIP5K;基因家族;雄性不育;表达模式

所属期刊栏目：30

分类号：S651(瓜果园艺)

资助基金：甘肃农业大学公开招聘博士科研启动基金2017RCZX-30

在线出版日期：2021-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：883-893