10.7606/j.issn.1004-1389.2021.06.009
葡萄NF-Y核因子家族的鉴定与表达分析
为阐明葡萄NF-Y核因子的理化性质、进化关系和在非生物胁迫下的表达情况,本研究从葡萄全基因组中鉴定出24个VvNF-Y核因子家族成员.生物信息学分析表明其编码的氨基酸数目为132~345 aa,pI为4.62~9.83,蛋白二级结构以α-螺旋和不规则卷曲为主,亚细胞定位发现葡萄NF-Y基因主要定位于细胞核中;系统进化分析表明进化树可分为3个亚族;顺式作用元件分析发现葡萄NF-Y基因家族具有大量核心元件,如光响应元件和响应多种激素和环境信号的元件,且多序列比对分析表明VvNF-Y的3个亚族均含有保守区;此外,选择性压力分析表明8对基因对的Ka/Ks均小于0.5,在进化过程中受到纯化选择作用;qRT-PCR 结果表明在500 μmol·L-1 ABA、10%PEG 和200 mmol·L-1 NaCl 处理时,VvNF-YA2、VvNF-YB3、VvNF-YB4和VvNF-YC3的表达量显著上升,且在10%PEG条件下,VvNF-YA1的表达量也显著上升,其余NF-Y核因子家族成员在受到ABA、NaCl和PEG处理时表达量下降.试验结果表明葡萄NF-Y核因子在参与葡萄不同的非生物胁迫时可能发挥不同的作用,为葡萄抗逆性研究提供了候选基因.
葡萄;NF-Y核因子家族;非生物胁迫;表达分析
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S663.1(果树园艺)
高等学校创新能力提升项目;学科建设专项基金
2021-09-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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870-882