甘蓝型油菜HD-ZIP基因家族的鉴定和表达分析

摘要：

为揭示HD-ZIP蛋白家族成员在甘蓝型油菜全基因组中的分布及相关特征,通过生物信息学方法共鉴定出74个HD-ZIP转录因子,分别被定位到甘蓝型油菜的19条染色体和8条随机序列;这74个HD-ZIP蛋白都含有高度保守的HD-ZIP结构域;系统发育进化树将该家族成员聚为4大类;共线性分析发现大部分基因不仅在A和C染色体组间存在共线性,而且在各自染色体组内也存在串联重复事件;基因表达分析发现,大部分HD-ZIP家族基因在根和叶中均有表达,并且在根中表达的基因多于叶片,受到盐胁迫处理时,大部分基因表达量会增加.初步明确了甘蓝型油菜HD-ZIP家族成员结构特点和相关功能,为进一步研究甘蓝型油菜HD-ZIP蛋白家族基因的生物学功能奠定了基础,为油菜抗性育种工作提供科学依据.

关键词：甘蓝型油菜、HD-ZIP蛋白基因家族、差异表达

所属期刊栏目：29

分类号：S565.4(经济作物)

资助基金：青海省春油菜遗传改良重点实验室项目;青海省自然科学基金

在线出版日期：2020-10-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：1351-1363