铁皮石斛两个DEAD-box RNA解旋酶基因克隆及特征分析

摘要：

为获得铁皮石斛DEAD-box RNA解旋酶(RH,RNA Helicase)基因并进行表达及序列分析,利用RACE从其叶片cDNA中分离RH基因,对编码蛋白相关理化特性进行生物信息分析;采用MEGA 6.0构建系统进化树;借助定量PCR技术检测基因表达特性.结果 表明:分离到铁皮石斛两个DEAD-box RH基因DoRH1和DoRH2(GenBank注册号KT957555和KT957556),全长为1 648 bp和1 851 bp,各编码1条由428和499个氨基酸组成的肽链,编码蛋白相对分子质量分别为48 206和55 432,等电点5.51和8.65;DoRH1和DoRH2蛋白均包含3个保守的RH结构域和多个基元,无信号肽或跨膜域,预测均定位在细胞核;两个基因与植物DEAD-box RH家族基因相似性高达80％以上;DoRH1、DoRH2分别聚在拟南芥、水稻、大豆和雷蒙德氏棉DEAD-box RH家族基因进化树的Ⅲ、Ⅳ支;DoRH1和DoRH2表达模式不同,DoRH1在根、茎、叶中表达量无显著差异,DoRH2在根中的相对表达量为叶中的3.26倍,茎与叶中无差异.

关键词：铁皮石斛、RNA解旋酶、基因克隆、表达模式、生物信息学分析

所属期刊栏目：29

分类号：Q943.2(植物学)

资助基金：陕西中医药大学新进博士科研启动经费;陕西中医药大学“秦药”品质评价及资源开发创新团队项目;思邈人才专项;陕西省高校首批青年杰出人才支持计划;咸阳市中青年科技领军人才项目

在线出版日期：2020-08-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1059-1067