东方百合'索邦'组蛋白去乙酰化酶基因LoSorHDA1的克隆与表达分析

摘要：

以东方百合'索邦'(Sorbonne)为材料,结合前期转录组数据,克隆组蛋白去乙酰化酶基因HDA1(Histone deacetylases),命名为LoSorHDA1.LoSorHDA1序列长1518 bp,编码505个氨基酸,生物信息学预测含有一个高度保守的组蛋白去乙酰化结构域.系统进化分析表明,LoSorHDA1与拟南芥等物种的HDA1同源蛋白聚为一支,而与HDAC家族其他成员关系较远;LoSorHDA1编码的氨基酸序列与单子叶植物小果野焦(Musa acuminata)的相似度最高,而双子叶植物HDA1则聚为另一支.RT-PCR结果显示:LoSorHDA1在'索邦'不同组织中普遍表达,其中在茎生根、嫩茎、花被片、花丝、柱头、花柱、子房中表达量较高,在下部叶和花药中表达稍弱.亚细胞定位表达结果表明,LoSorHDA1定位在细胞核和细胞质中.荧光定量PCR结果显示:LoSorHDA1在不同花发育阶段中的各个花部组织中均有不同程度的表达,在雌雄蕊中表达趋势相反,而在内外花被片中的表达趋势较为一致,说明LoSorHDA1可能参与东方百合花发育进程,这为后续LoSorHDA1的去乙酰化修饰在百合花发育中的功能研究奠定基础.

关键词：百合’索邦’、LoSorHDA1、基因克隆、基因表达

所属期刊栏目：29

分类号：S682.2(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：中央高校基本科研业务费专项资金;国家自然科学基金;中央高校基本科研业务费专项资金;北京林业大学建设世界一流学科和特色发展引导专项资金

在线出版日期：2020-04-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：315-325