交链格孢菌EST-SSR信息分析与分子标记通用性评价

摘要：

为了弄清交链格孢菌(Alternaria alternata)EST数据库中的SSR信息资源,并开发可用于研究近缘种细极链格孢(Alternaria tenuissima)遗传多样性的EST-SSR分子标记.从NCBI数据库下载A.alter-nata表达序列标签(Expressed sequence tag,EST)共727条,经过研究分析发现,A.alternata EST中SSR含量非常丰富,每5.343 kb含有1个SSR位点.根据SSR两端保守序列,设计合成13对EST-SSR引物,对来自新疆不同地区不同寄主的38株A.tenuissima进行通用性检测.检测结果显示共有5对引物能扩增出多态性条带,扩增多态率为55.56％.因此,基于A.alternata EST数据库开发的SSR分子标记,在开展近缘种A.tenuissima遗传多样性研究时具有较好的通用性.

关键词：交链格孢菌、细极链格孢菌、EST-SSR、通用性

所属期刊栏目：29

分类号：Q36(微生物遗传学)

资助基金：国家自然科学基金;塔里木大学大学生创新训练项目

在线出版日期：2020-04-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：157-163