玫烟色棒束孢基因组候选效应因子的预测分析

摘要：

在玫烟色棒束孢(Isaria fumosorosea)全基因组10 061个蛋白质序列的基础上,经过SignalP v4.1分析得到1 112个具有信号肽的蛋白序列;以此为基础用TMHMM v2.0分析得到1 030个跨膜数小于2的蛋白序列;1 030个具有信号肽的蛋白经过TargetP v 1.1分析得到1 001个定位为S的蛋白序列;最后经过ProtComp v 9.0分析,得到929个蛋白质定位于细胞质中的分泌蛋白序列.929个蛋白中包含半胱氨酸含量大于等于6的蛋白序列共495个,其中146个蛋白序列的串联重复序列大于或等于9.共137个蛋白在病原物—寄主互作数据库(Pathogen-host interaction database,PHI)中获得注释,其中91个蛋白为候选效应蛋白.挑取小于300个氨基酸的蛋白序列,共筛选到19个候选效应因子.最终从10 061个蛋白序列中筛选得到19个候选致病效应因子.

关键词：玫烟色棒束孢、效应因子、全基因组、分析

所属期刊栏目：28

分类号：S641.1

资助基金：广东省应用型科技研发专项;广东大学生科技创新培育专项;广东省大学生创新创业训练计划

在线出版日期：2020-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2078-2083