10.7606/j.issn.1004-1389.2019.06.011
铁皮石斛2个P型H+-ATPase基因的克隆、表达及生物信息学分析
利用RACE进行铁皮石斛质膜PMA(plasma membrane H+-ATPase)基因的全长克隆,采用生物信息学方法、DNASTAR 7.0和MEGA 7.0对其编码蛋白结构、序列和分子进化等进行分析,并借助实时荧光定量PCR技术检测基因表达模式.结果 表明,从铁皮石斛叶片cDNA中分离到2个P型H+-ATPase基因DoPMA1和DoPMA2(GenBank注册号KU160470和KU160471),各编码1条由973和951个氨基酸组成的肽链;2个基因编码蛋白均含有2个保守的P型ATPase结构域和5个H+运输ATPase结合位点,不含信号肽,定位在质膜.2个蛋白与植物H+-ATPases蛋白相似性大于72%,聚在拟南芥、水稻等植物H+-ATPase分子进化树的Ⅴ和Ⅱ分支.实时荧光定量PCR分析表明,Do PMA1在根和茎中上调,分别为叶中的2.98、1.95倍,DoPMA2在根与叶中表达无显著差异,茎中下调为叶中的0.86倍.研究结果为进一步揭示DoPMA1和DoPMA2分子作用奠定基础.
铁皮石斛、质膜ATPase、克隆、表达模式、生物信息学分析
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R282.12(中药学)
陕西省高校首批青年杰出人才支持计划项目;咸阳市中青年科技领军人才项目;陕西省教育厅专项18JK0216;陕西中医药大学新进博士科研启动经费104080001;陕西中医药大学“秦药”品质评价及资源开发创新团队项目2019-QN01
2019-07-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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