葡萄HAK基因家族的鉴定与表达分析

摘要：

从葡萄基因组数据库中检索到18个HAK基因家族成员,对其在生物信息学及非生物胁迫下的表达水平进行分析.结果 表明:葡萄HAKs编码CDS序列长度为2 000～2 500 bp,外显子数从7个到12个不等.二级结构主要以α-螺旋和不规则卷曲为主,至少含9个跨膜区域,亚细胞定位表明该家族主要在细胞质膜上.葡萄HAK基因分为7个亚族且整个家族与拟南芥HAK家族成员的同源性很高.基因芯片表达谱分析表明,葡萄HAK基因家族能够响应高温、低温、盐、干旱和水分等非生物胁迫,不同成员的表达水平存在一定的差异.荧光定量分析表明,VvHAK01、VvHAK04、VvHAK06和VvHAK13质量分数为10％ PEG处理6 h后表达量显著上升;VvHAK02、VvHAK07、VvHAK09、VvHAK10、VvHAK12、VvHAK13、VvHAK15、VvHAK16、VvHAK17、VvHAK18在50 μmol·L-1 ABA处理6h后表达量显著上升;VvHAK07、VvHAK09、VvHAK11在400 mmol· L-1 NaCl处理6h后表达量显著上升;VvHAK05在50μmol·L-1 ABA、400 mmol·L-1 NaCl和质量分数为10％的PEG处理6h后,叶片表达量显著下调.大多数HAK基因家族成员对ABA、NaCl和PEG无法有响应,试验为进一步解析HAK基因功能和利用HAK基因进行植物的遗传改良奠定基础.

关键词：葡萄、HAK家族、生物信息学、基因芯片表达谱、qRT-PCR

所属期刊栏目：28

分类号：S663.1(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金31460500;甘肃省葡萄酒产业发展专项资金

在线出版日期：2019-07-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：922-934