萝卜根径发育候选基因的初步筛选

摘要：

为了鉴定调控不同萝卜品种间根大小性状差异的关键基因,利用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术,对2种根直径大小不同的圆球形萝卜‘扬州圆白’(直径大)和‘萨丁’(直径小)进行差异表达基因分析.测序共获得1468个差异表达转录本.基于基因功能注释分析,共鉴定到参与细胞壁代谢相关的转录本28个,参与蔗糖代谢相关的转录本2个,参与激素合成与信号转导相关的转录本29个.利用RT-qPCR分析对6个细胞壁代谢相关基因的表达模式进行验证,其结果与测序结果基本一致.研究发现参与植物激素合成与激素信号转导相关基因(TIFYs、DELLA、ERF2和CYCD3)、蔗糖代谢相关基因(ATBE-TAFRUCT4和HK3)和细胞壁代谢相关基因(XTHs、EXPs和COBs)可能是调控‘扬州圆白’和‘萨丁’萝卜根大小品种间差异的关键基因.

关键词：数字基因表达谱、萝卜、根、大小、基因

所属期刊栏目：28

分类号：S631.1(蔬菜园艺)

资助基金：国家自然科学基金31671599;安徽省高校省级自然科学项目KJ20168014;安徽自然科学基金1708085MC55

在线出版日期：2019-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：567-577