陆地棉GhSAMDC基因家族的全基因组分析

摘要：

以已报道的SAMDC为探针序列,从异源四倍体陆地棉基因组数据库中筛选获得14个GhSAMDC家族基因.GhSAMDC家族基因的氨基酸多重序列比对发现该家族成员序列相似性约为50％,家族成员均具有Gh SA MDC家族特有的保守结构域:酶原剪切位点结构域(LSESSLF)和PEST(TIH VTPEDGFSYAS)结构域.染色体定位分析发现14个基因均匀地分布在A和D基因组,A和D上各含7个GhSAMDC成员,无家族成员构成基因簇的现象.转录组测序结果发现GhSAMDC1、GhSAMDC7和GhSAMDC8对黄萎病菌的胁迫有明显的响应,暗示这些在棉花抵御黄萎病菌胁迫过程中发挥一定的作用.试验为进一步研究GhSAMDC家族基因的功能及解析棉花抗黄萎病分子机制奠定了一定基础.

关键词：陆地棉、SAMDC、基因家族、黄萎病

所属期刊栏目：28

分类号：S562(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金31301394;石河子大学动植物育种专项重点项目YZZX201601

在线出版日期：2019-05-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：388-396