绵羊TGFβ2基因及其剪切体的克隆与生物信息学分析

摘要：

旨在克隆绵羊TGFβ2(Transforming growth factor-β2)基因CDS,解析其序列及编码蛋白的生物学特性,为绵羊生产利用提供理论基础.采用PCR技术克隆获得TGFβ2基因的CDS,并进行生物信息学分析.结果表明:绵羊TGFβ2基因的CDS长度为1 329 bp,编码442个氨基酸;其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2由于CDS部分缺失分别编码331和414个氨基酸.绵羊TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2编码蛋白的理论等电点分别为8.74、7.60和8.82,均存在1个信号肽和1个跨膜结构域,由α-螺旋、β折叠、延伸及无规则卷曲构成;序列同源性分析发现,绵羊TGFβ2基因编码区的核苷酸和氨基酸序列与其他哺乳动物同源性较高,进化树分析表明,绵羊TGFβ2氨基酸序列与人类的进化关系较近,与斑马鱼较远;细胞定位分析表明TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2主要在细胞外基质中发挥作用,调控下游靶基因的表达.获得绵羊TGFFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2完整的CDS,与TGFβ2转录本相比,TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2分别缺失111和28个氨基酸序列,其可能通过与TGFβ2转录本不同的分子调控机制发挥重要的生物学作用.

关键词：绵羊、TGFβ2、克隆、编码区、生物信息学

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分类号：S826;Q81(家畜)

资助基金：新疆维吾尔自治区重点实验室开放课题2017D04028;新疆维吾尔自治区科研机构创新发展专项2016D04001;国家国际合作专项2014DFA30970

在线出版日期：2018-08-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：929-937