甜樱桃栽培种指纹图谱构建及遗传多样性分析

摘要：

为了对甜樱桃品种进行分子鉴别及分析不同品种间的亲缘关系,以叶片直接进行PCR扩增,采用EST-SSR分子标记技术构建生产上常用的40个甜樱桃栽培品种的数字指纹图谱和模式指纹图谱数据库(Cluster Project)并进行遗传多样性分析.采用24对甜樱桃核心引物对所有品种基因组进行扩增,共检测到129个等位位点,包括118个多态性位点,多态性比率为91.2％.每对引物扩增出的等位位点数3～10个,每对引物平均扩增5.38个基因型,扩增条带大小介于100～500 bp,多态信息含量(PIC)为0.654,基因流(Nm)为1.402,平均杂合率为0.495.8对引物,即PA17、PA32、PA51、PA54、PA73、PA99、PA101和PA202可作为指纹图谱构建的首选引物,利用其中的PA17、PAS1、PA99、PA101和PA202以引物组合方式构建指纹图谱可区分40个品种;聚类分析表明在遗传距离0.71处40个品种被分为5类,聚类结果与品种的特性及成熟期具有较高的一致性.

关键词：甜樱桃、EST-SSR标记、指纹图谱、遗传多样性、聚类分析

所属期刊栏目：26

分类号：Q663.4(生物力学)

资助基金：The National Natural Science Fund31370400;Dandong Project of Science and Techenology in 20162016KJ001;Eastern Liaoning University Foundation Youth Fund Project No.2015QN006.国家自然科学基金31370400;丹东市2016科技攻关2016KJ001;辽东学院青年基金2015QN006

在线出版日期：2018-02-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1813-1820