梨树CDPK基因家族进化和表达分析
万方数据知识服务平台
应用市场
我的应用
会员HOT
万方期刊
×

点击收藏,不怕下次找不到~

@万方数据
会员HOT

期刊专题

10.7606/j.issn.1004-1389.2017.07.010

梨树CDPK基因家族进化和表达分析

引用
钙依赖蛋白激酶(CDPK或CPK)在植物生长和发育、逆境信号刺激及其对病原物的防御反应过程中发挥着非常重要的作用.本研究利用梨树全基因组数据,采用生物信息学的方法,在全基因组水平上对梨树CDPK基因家族进行系谱进化关系、基因结构、共线性关系及表达情况等分析.结果表明,梨树基因组中共存在31个CDPK基因,命名为PbCDPK1~PbCDPK31.系谱分析结果表明,这些CDPK基因归属于4个亚家族.共线性分析检测到12对CDKP基因间存在显著的共线性关系,其中10对由最近一次发生的全基因组复制事件形成.非同义/同义置换率的比率(dN/dS)说明CDPK基因在功能上进化得非常保守.荧光定量PCR结果发现,5个梨树CDPK基因对干旱逆境有响应.试验结果可为进一步开展梨树CDPK基因家族的功能鉴定和分子进化机制的研究提供参考.

梨树、CDPK基因、生物信息学、进化、干旱

26

S661.2(果树园艺)

Jiangsu Natural Science FoundationBK20131243;Jiangsu SanxinThree New Agricultural ProjectSXGC[2015]311;Qinglan Project of Jiangsu Province.江苏省自然科学基金BK20131243;江苏省农业三新工程SXGC[2015]311;江苏省青蓝工程

2017-08-28(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共7页

1026-1032

相关文献
评论
暂无封面信息
查看本期封面目录

西北农业学报

1004-1389

61-1220/S

26

2017,26(7)

相关作者
相关机构

专业内容知识聚合服务平台

国家重点研发计划“现代服务业共性关键技术研发及应用示范”重点专项“4.8专业内容知识聚合服务技术研发与创新服务示范”

国家重点研发计划资助 课题编号:2019YFB1406304
National Key R&D Program of China Grant No. 2019YFB1406304

©天津万方数据有限公司 津ICP备20003920号-1

信息网络传播视听节目许可证 许可证号:0108284

网络出版服务许可证:(总)网出证(京)字096号

违法和不良信息举报电话:4000115888    举报邮箱:problem@wanfangdata.com.cn

举报专区:https://www.12377.cn/

客服邮箱:op@wanfangdata.com.cn