猪流行性腹泻病毒ORF3基因的克隆及序列分析

摘要：

为研究2015年重庆市荣昌部分腹泻猪场是否有猪流行性腹泻病毒的感染与流行,对猪流行性腹泻病毒ORF3 (Open reading flame 3)基因进行克隆及序列分析研究.通过从疑似流行性腹泻病毒感染的猪场采集小肠组织,采用RT-PCR方法对猪流行性腹泻病毒的ORF3基因进行克隆.结果表明,所获得的ORF3基因ORF长675bp,编码223个氨基酸.通过DNAMAN软件分析,表明本研究中克隆的ORF3基因与CV777标准株(AF353511)的ORF3基因相似性为96.45％,与中国的NJ (KJ642645)的相似性最高,为99.41％,与attenuated DR13疫苗株(EU054930)相似性90.52％,而与CV777疫苗株(GU372744)相似性仅79.07％.系统进化树分析表明,该基因与中国毒株、韩国毒株以及美国分离株USA/ Illinois 201/2014(KR265795)处于同一进化分支上,而attenuated DR13疫苗株、CV777 truncated疫苗株和欧洲的CV777标准株处于另一个进化分支上,说明该基因与中国毒株、韩国毒株的遗传距离最近.通过B细胞抗原表位预测分析,发现其氨基酸第65～68、114～116、137～140和150～154区域可能有潜在的优势抗原表位.成功克隆了猪流行性腹泻病毒ORF3基因,说明2015年重庆市荣昌部分腹泻猪场存在猪流行性腹泻病毒的感染.

关键词：猪流行性腹泻病毒、ORF3基因、序列分析

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分类号：S851.34(动物医学（兽医学）)

资助基金：Rongchang Campus Youth Science Foundation of Southwest UniversityRC20700925&RC20700421;Fundamental Research Funds for the Central Universities No.XDJK2015C032.西南大学荣昌校区青年科学基金RC20700925&RC20700421;中央高校基本业务费专项基金XDJK2015C032

在线出版日期：2017-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：968-974