小麦淀粉合成相关酶基因SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb表达序列多态性及对淀粉质量分数的影响

摘要：

为了探究小麦淀粉合成相关酶SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb基因表达序列核苷酸多态性及其与淀粉质量分数的关系,根据GenBank中已公布的基因序列设计特异引物,克隆基因的表达序列并测序,通过Clustal X2比对分析,用Dnasp 5.0计算核苷酸多态性信息,并建树做单倍型与淀粉质量分数的相关分析.结果表明,克隆得到3个基因的ORF(Open reading frame)序列,NCBI/Blast同源比对SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb与GenBank中已登记的序列的同源性分别为98.19％、98.64％和99.04％.在SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb中分别发现40、14和18个SNP位点,其中共包括4个InDel.在,SSⅡa中,其第2外显子区为变异富集区,Tajima's D检验D值均不显著.可见,这3个基因的多态性信息均较丰富,其单核苷酸多态性与小麦淀粉质量分数之间存在一定的对应关系.

关键词：小麦、表达序列、核苷酸多态性、淀粉质量分数

所属期刊栏目：25

分类号：S330(作物遗传育种与良种繁育)

资助基金：国家自然科学基金31260357.National Natural Science Foundation of China 31260357

在线出版日期：2016-08-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1150-1157