青稞HbTsi1的克隆及其序列特征与表达特性分析

摘要：

为了探究DREB类基因在青稞干旱胁迫下的表达模式,通过RT-PCR技术从抗旱品种‘喜马拉雅10号’中克隆其中的一个基因全长cDNA,并利用Real Time PCR方法研究其在干旱胁迫、复水条件下的表达情况.结果表明:从抗旱材料中克隆一个1 237 bp全长cDNA序列,命名为Hb TM1(登录号:KJ699390).生物信息学分析表明,该序列开放阅读框长为837 bp,编码278个氨基酸序列,由HbTsi1的ORF推测所编码的蛋白,预测分子质量为30.33 ku,等电点(pI)为6.11.Prosite Scan分析结果表明,该基因含有AP2/ERF domain profile家族特征基序、1个Bipartite nuclear localization signal profile、6个蛋白激酶C磷酸化位点、6个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、5个N-豆蔻酰化位点、2个cAMP和cGMP依赖性的蛋白激酶磷酸化位点、2个氮糖基化位点.TMHMM预测该蛋白不含跨膜转移功能区.Signal IP3.0预测该蛋白没有信号肽,不属于分泌蛋白.PSORT亚细胞定位预测该基因所编码蛋白位于细胞质.推导的氨基酸序列同源比对分析结果表明,HbTsi1蛋白与短芒大麦的DREB蛋白具有较高的相似性.利用实时定量PCR方法研究HbTsi1在干旱胁迫条件下及复水后不同时间点的表达情况,发现HbTsi1在土壤绝对含水量为33.4％时表达量最高,随着土壤绝对含水量的下降而下调表达;当达到作物正常生长所需的土壤绝对含水量时又开始上调表达;进行干旱胁迫后(＜15.5％)基因表达量下降;复水后8h时恢复至最高表达水平.说明,HbTsi1基因可能是青稞抗旱节水的关键基因.

关键词：青稞、干旱胁迫、HbTsi1、基因克隆、表达模式

所属期刊栏目：24

分类号：S512.3(禾谷类作物)

资助基金：973计划前期研究专项2012CB723006;国家科技支撑计划2012BAD03B01,2013BAD30B01;西藏财政专项2014CZZ001

在线出版日期：2015-12-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：56-62