基因本体论在福氏志贺菌转录组研究中的应用

摘要：

利用RNA-seq技术进行环丙沙星敏感和耐药的福氏志贺菌2457T株的序列测定与组装,对其碱基序列借助基因本体(Gene Ontology,GO)在生物进程、细胞组分、分子功能三方面进行注释和生物学分析.研究经过耐药诱导的转录组差异表达情况,并探讨差异表达基因在耐药性产生过程中的作用及相互关系.结果表明,通过耐药诱导有3 641个基因差异表达,其中961个GO条目注释到39个功能类别.同时发现硫酸盐、硝酸盐氧化还原相关酶系,电子/H+传导基因,膜转运蛋白,ABC外排泵家族4类耐药相关的功能基因组分.

关键词：RNA-seq、福氏志贺菌、转录组、基因本论

所属期刊栏目：23

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金31272603、31101836

在线出版日期：2015-12-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：17-24