肾型IBV陕西分离株CK/CH/Shaanxi/2009/H09全基因的克隆与序列分析

摘要：

为了解鸡肾型传染性支气管炎病毒陕西流行株的分子生物学特征,参考DY07株全基因核苷酸序列设计22对引物,采用RT-PCR方法对西北农林科技大学动物医学院禽病研究室分离的1株肾型IBV陕西分离株CK/CH/Shaanxi/2009/H09的全基因进行分段扩增并测序,将测序成功的各序列依次拼接,得到全基因序列后进行序列比对分析.研究结果表明,该分离株基因组全长27 675 bp,共有10个开放阅读框,其基因排序为5'cap-Replicase-S-3a-3 b-3c-M-5a-5 b-N-poly(A)3',纤突蛋白裂解位点为到536 RRFRR540,3a、5a和N基因的大小与参考毒株相比是保守的,但编码其他蛋白的基因长度存在差异;同源性分析结果显示,该毒株与48个参考毒株的同源性为85.2％～93.5％;系统进化树分析结果显示,该毒株与中国分离株ck/CH/LDL/091022、YX10株和DY07株的亲缘关系较近,同属于中国近年来主要流行的血清型毒株,但在基因水平上已经产生一定程度的变异.

关键词：鸡肾型传染性支气管炎病毒、全基因、序列分析

所属期刊栏目：22

分类号：S858.31(动物医学（兽医学）)

资助基金：陕西省科技统筹创新工程计划项目2011KTDZ02-01;陕西省自然科学基础研究计划项目SJ08C110

在线出版日期：2015-12-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：189-194