民猪耐寒基因目标风险最小特征搜索

摘要：

面对小样本海量特征的基因芯片数据,准确高效地筛选分类特征基因是数据分析的重要工作.通过制备常温状态和低温状态两类地方民猪样本的基因芯片数据,以抗寒性状相关基因筛选为目的,提出目标风险最小特征搜索算法,通过设定目标参数筛选出抗寒性状相关的基因集合.这些抗寒性状相关基因对两类样本分类效果非常好,通过与经典的分类方法相比较,多种方法都获得稳定高效的分类准确率,该特征筛选过程获得的抗寒相关基因具有较强的分类效能.通过基因功能生物学注释,得到特征基因所在的功能结点信息,这些已知基因的功能为进一步研究特征基因集合中未知基因的功能提供了试验设计依据.目标风险最小特征搜索的同时可以进行样本分类和重要分类特征的筛选,适用于基因表达谱数据的统计分析.

关键词：基因芯片、特征搜索、抗寒、分类效能、目标风险最小特征算法

所属期刊栏目：22

分类号：S813.3(普通畜牧学)

资助基金：黑龙江省自然科学青年基金QC2012C034;黑龙江省博士后基金LBH-Z10039

在线出版日期：2015-12-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：15-21