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10.3969/j.issn.1004-1389.2011.05.021

水稻土氨氧化细菌多样性的RFLP分析

引用
提取苗期水稻根际土和非根际土土样微生物总DNA,采用氨氧化细菌特异性引物(Eub338,Nso1225)扩增16S rDNA基因片段,分别建立水稻根际土(G)和非根际土(F)氨氧化细菌克隆文库.用限制性内切酶HhaⅠ/RsaⅠ进行PCR-RFLP分型,分别得到110和105个酶切类型.多样性指数和优势细菌聚类比对结果显示,土壤氨氧化细菌群落结构指数H'、Dg和Jg为非根际土稍大于根际土,表明非根际土中氨氧化细菌种群比根际土略多.指数Hmax和dMax为根际土大于非根际土,表明根际土氨氧化细菌数量相对多于非根际土.根际土有比非根际土更明显的优势种群出现.序列分析表明,水稻根际土氨氧化细菌的优势种群主要属于亚硝化螺菌属,亚硝化单胞菌属,β-变形菌亚门,碱菌属.供试水稻根际土和非根际土氨氧化细菌多样性和群落结构发生了改变.

水稻土、氨氧化细菌、多样性、RFLP

20

S511(禾谷类作物)

国家自然科学基金40971158

2011-09-29(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共6页

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西北农业学报

1004-1389

61-1220/S

20

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