小鼠胚胎干细胞核心转录因子nanog靶基因Zbtb9的生物信息学分析

摘要：

通过特异性引物用RT-PCR方法扩增Zbtb9基因.利用生物信息学对小鼠的Zbtb9基因启动子进行生物信息学分析,预测Zbtb9基因启动子位置和启动子区内含有的转录因子结合位点,以及nanog在Zbtb9基因转录调控中的作用及Zbtb9蛋白的基本性质.Zbtb9基因启动子区可能定位于转录起始点上游790 bp至1 024 bp之间.启动子区内含有15个转录调控因子结合位点,nanog的作用靶序列位于Zbtb9基因启动子区与转录起始位点之间,提示nanog在Zbtb9基因转录调控中起作用,小鼠Zbtb9蛋白二级结构可能以螺旋为主,富含疏水性氨基酸;对Zbtb9基因疏水区的氨基酸进行跨膜区分析,提示可能是跨膜蛋白.经SMART分析,Zbtb9蛋白含有BTB/POZ结构域.

关键词：小鼠干细胞转录因子、nanog基因、Zbtb9基因、生物信息学分析

所属期刊栏目：17

分类号：S865.1+3(狩猎、野生动物驯养)

在线出版日期：2008-12-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：21-25