牦牛SPAG11基因克隆与生物信息学分析

摘要：

[目的]克隆牦牛(Bos grunniens)精子相关抗原11(Sperm-Associated Antigen 11,SPAG11)基因,并了解其分子结构特征,为进一步研究牦牛SPAG11生物学功能奠定基础.[方法]从牦牛睾丸中提取总RNA,RTPCR扩增并克隆SPAG11C、SPAG11D和SPAG11E基因,测序后进行生物信息学分析.[结果]克隆出牦牛SPAG11基因3个亚型:SPAG11C、SPAG11D和SPAG 11E,序列大小分别是351,408和261 bp,分别编码117,129和80个氨基酸,其中SPAG11D和SPAG11E序列包含1个完整开放阅读框(ORF),SPAG11C序列包含部分ORF.牦牛SPAG11C、SPAG11D和SPAG11E核苷酸序列与黄牛(Bos taurus)相应序列相似性最高,而与黄牛β-防御素1相似性较低(＜50％).3个蛋白亚型均具有β-防御素家族基本特性,生物信息学分析显示其均含有磷酸化位点.[结论]成功克隆牦牛SPAG11C、SPAG11D和SPAG11E基因,明确了其编码蛋白的分子结构特征.

关键词：牦牛、精子相关抗原11、β-防御素、生物信息学

所属期刊栏目：44

分类号：S823.8+5;Q78(家畜)

资助基金：教育部“长江学者和创新团队发展计划”创新团队项目IRT0848;国家自然科学基金项目31172379;四川农业大学学科建设双支计划项目3570806

在线出版日期：2017-03-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：28-34,44