安徽东流水牛线粒体D-Loop区遗传多样性与系统进化分析

摘要：

[目的]分析安徽东流水牛群体的分子遗传特性,为今后开展我国地方水牛品种研究提供科学依据.[方法]采用测序技术测定安徽东至县31头东流水牛线粒体DNA(mtDNA) D-Loop序列,结合GenBank数据库中已报道的22个群体的471条中国水牛D-Loop序列进行联合分析,利用DnaSP 5.1软件统计核苷酸多样性和单倍型多样性,利用MEGA 5.10软件构建N-J系统发生树,利用Network 4.60软件构建单倍型的media-joining网络.[结果]在22个中国水牛群体中发现163个变异位点,180个单倍型,其核苷酸多样性为0.018 23±0.002 21,单倍型多样性为0.877 40±0.013 80,其中在东流水牛D-Loop序列中发现70个变异位点,构成35种单倍型,其核苷酸多样性为0.013 31±0.002 08,单倍型多样性为0.944 00±0.023 00,群体变异性水平与中国其他水牛群体接近.N-J系统发生树和media-joining进化网络显示,中国水牛分为沼泽型和江河型,前者又分为A和B支系,B支系包括b1和b22个亚支系,东流水牛分布于A和B支系中.[结论]东流水牛群体遗传多样性丰富,且线粒体具有2个母系来源.

关键词：水牛、线粒体DNA、遗传多样性、单倍型

所属期刊栏目：44

分类号：S823.8+32(家畜)

资助基金：国家肉牛牦牛产业技术体系项目-合肥综合试验站CARS-38;安徽省农业科学院院长青年创新基金项目14B0428

在线出版日期：2017-03-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：21-27